התנועה לאיכות השלטון הגיבה על החלטת בג"ץ בעניין מינוי עמיר פרץ ליו"ר התעשייה האווירית בניגוד לעמדת הוועדה לבחינת מינויים: "למרות שאנו מצרים על ההחלטה במישור התוצאה, גם השופטים סברו והדגישו בפסק הדין את העובדה ש'העותרת העמידה לדיון שאלה חשובה מבחינה ציבורית' ואנו שמחים שבכך ביצענו את תפקידנו וניסינו למנוע מינוי שבעינינו עבר בצורה לא תקינה.
״חרף דחיית העתירה, פסק הדין הדגיש את חשיבות המינוי של דירקטורים לחברות ציבוריות, ככל הניתן מתוך נבחרת הדירקטורים, או לכל הפחות במסלול תואם נבחרת תוך השוואה פרטנית למועמדים מתוך הנבחרת ותוך הצדקה מיוחדת למינוי שכזה. כמו כן, הודגשה החשיבות של הוועדה לבדיקת מינויים 'כגוף מקצועי המופקד על הבטחת כשירותם ויכולותיהם המקצועיות והאישיות של המועמדים לכהן כדירקטורים בחברות ממשלתיות. זאת, מתוך שאיפה לשמירה על טוהר הליכי המינוי ולחתירה לאיוש מיטבי של נושאי המשרה בחברות אלו'.
"כבוד השופטת ברק ארז אף ציינה בפסק הדין כי 'ככלל, על מדינת ישראל לשאוף לכך שהמינויים בזירה הציבורית לא יהיו רק מינויים 'טובים' או 'אפשריים'… בשלב זה נותר אך להצטער על כך שמינויו של מר פרץ לא נבחן באופן השוואתי לצדם של מועמדים נוספים, בהתאם למתכונת שפורטה לעיל. הדבר היה יכול לשרת לא רק את האינטרס הציבורי, אלא גם את מראית פני הצדק, וייתכן שאף את המועמד עצמו. ניתן לצפות כי יופקו הלקחים הנדרשים מכך.
"אנו שמחים על כך שחרף התוצאה הסופית אליה הגיעו השופטים בפסק הדין, העתירה תרמה לחידוד הפרקטיקה הראויה בהיבטי מינויים לתפקידים בכירים בשירות הציבורי, ולשמירה על טוהר המידות ואיכות השלטון. כך נמשיך לפעול גם בעתיד".